通政使司
通政使司与各部门之间的收发出纳机关，处理内外章疏敷奏封驳之事。
通政使 一人 正三品 通政使司
左通政 一人 正四品 通政使司
右通政 一人 正四品 通政使司
誊黄右通政 一人 正四品 通政使司
左参议 一人 正五品 通政使司
右参议 一人 正五品 通政使司
经歷 一人 正七品 通政使司经歷司
知事 一人 正八品 通政使司
翰林院
明以后翰林院成为养才储望之所，负责修书撰史，起草詔书，为皇室成员侍读，担任科举考官等。
学士 一人 正五品 翰林院
侍读学士 二人 从五品 翰林院
侍讲学士 二人 从五品 翰林院
侍读 二人 正六品 翰林院
侍讲 二人 正六品 翰林院
五经博士 九人 正八品 翰林院
典籍 二人 从八品 翰林院
侍书 二人 正九品 翰林院
待詔 六人 从九品 翰林院
孔目 一人 未入流 翰林院
史官修撰 无定员 从六品 翰林院
编修 无定员 正七品 翰林院
检讨 无定员 从七品 翰林院
庶吉士 无定员 未入流 翰林院
国子监
国子监是教育体系之最高学府；同时作为当时国家教育的主管机构，隶属礼部。
祭酒 一人 从四品 国子监
司业 一人 正六品 国子监
监丞 一人 正八品 国子监绳愆厅
五经博士 五人 从八品 国子监博士厅
助教 十五人 从八品 国子监率性、修道、诚心、正义、崇志、广业六堂
学正 十人 正九品 国子监
学录 七人 从九品 国子监
典簿 一人 从八品 国子监典簿厅
典籍 一人 从九品 国子监典籍厅
掌饌 二人 未入流 国子监掌饌厅
衍圣公 一人 正二品 孔氏世袭
教授 从九品 教授司 孔、顏、曾、孟四氏
六科
吏科都给事中 一人 正七品 吏科
户科都给事中 一人 正七品 户科
礼科都给事中 一人 正七品 礼科
兵科都给事中 一人 正七品 兵科
刑科都给事中 一人 正七品 刑科
工科都给事中 一人 正七品 工科
吏科左给事中 一人 从七品 吏科
吏科右给事中 一人 从七品 吏科
户科左给事中 一人 从七品 户科
户科右给事中 一人 从七品 户科
礼科左给事中 一人 从七品 礼科
礼科左给事中 一人 从七品 礼科
兵科左给事中 一人 从七品 兵科
兵科右给事中 一人 从七品 兵科
刑科左给事中 一人 从七品 刑科
刑科右给事中 一人 从七品 刑科
工科左给事中 一人 从七品 工科
工科右给事中 一人 从七品 工科
给事中 四人 从七品 吏科
给事中 六人 从七品 礼科
给事中 八人 从七品 户科
给事中 十人 从七品 兵科
给事中 八人 从七品 刑科
给事中 四人 从七品 工科
尚宝司
卿 一人 正五品 尚宝司
少卿 一人 从五品 尚宝司
司丞 三人 正六品 尚宝司
中书科
中书舍人 二十人 从七品 中书科
行人司
司正 一人 正七品 行人司
左司副 一人 从七品 行人司
右司副 一人 从七品 行人司
行人 三十七人 正八品 行人司
钦天监
监正 一人 正五品 钦天监
监副 二人 正六品 钦天监主簿厅
主簿 一人 正八品 钦天监主簿厅
官正 五人 正六品 钦天监 春、夏、中、秋、冬各一人
五官灵台郎 四人 从七品 钦天监
五官保章正 一人 正八品 钦天监
五官挈壶正 一人 从八品 钦天监
五官监候 二人 正九品 钦天监
五官司歷 二人 从九品 钦天监
五官司晨 二人 从九品 钦天监
漏刻博 一人